Впервые команда Кыргызской Республики приняла участие в Международной олимпиаде по химии в 1998 году. В 2003 году Сыргак Жумабаев завоевал первую бронзовую медаль, в 2007 году Кайнар Камалов завоевал первую серебряную медаль.
К настоящему времени команды страны получили 2 серебряные, 20 бронзовых и 12 почетных грамот.
— 2002 год – 3 почетные грамоты,
— 2003 год — бронзовая медаль и 2 почетные грамоты,
— 2005 год — 3 бронзовые медали,
— 2006 год — бронзовая медаль и почетная грамота,
— 2007 год — серебряная медаль и почетная грамота,
— 2008 год — бронзовая медаль и почетная грамота,
— 2009 год — бронзовая медаль,
— 2012 год — бронзовая медаль,
— 2015 год — бронзовая медаль и почетная грамота,
— 2016 год — бронзовая медаль,
— 2017 год — 2 бронзовые медали,
— 2018 год — почетная грамота,
— 2019 год — бронзовая медаль,
— 2020 год — серебряная медаль и 2 бронзовые медали,
— 2021 год — бронзовая медаль,
— 2022 год — 2 бронзовые медали,
— 2023 год — бронзовая медаль и почетная грамота,
— 2024 год — бронзовая медаль и почетная грамота.